Vastavalt Eesti Puitmajaliidu põhikirjale on liidu juhatus viie- kuni seitsmeliikmeline ning valitakse kaheks aastaks. Juhatusse kuulub vähemalt üks esindaja nii käsitööna palkmajade, masinpalkmajade kui puitkarkassmajade (sh elementmajade) tootjatest.
Eesti Puitmajaliidu juhatuse koosseis 03.04.2019.a. toimunud üldkoosoleku otsusel:
Martin Talts - KMT Prefab OÜ (juhatuse aseesimees)
e-post: martin@kmt.ee
Tegevjuht:
Lauri Kivil
e-post: lauri@puitmajaliit.ee